外泌体RNA测序
Exosomes作为活细胞分泌的含有RNA和蛋白质的微囊,广泛分布于外周血、尿液、唾液、腹水、羊水等多种体液中。体液中exosomal RNA(特别是miRNA等非编码RNA)在不同的疾病模型中存在明显的表达差异。通过高通量技术对外泌体RNA进行测序,可快速高效获得外泌体RNA的全面信息,是疾病诊断和随访的理想手段。
润基生物提供外泌体提取试剂盒,能够快速分离提取exosome RNA进行建库测序,满足外泌体mRNA,lncRNA,circRNA,miRNA的不同研究需求。
1. Long RNA
由于很多基因位点会生成转录方向相反的、具有重要调控功能的反义RNA。常规的建库方法无法区分这些反义RNA,我们采用链特异性的建库方法,可以准确检测反义RNA,从而提供更全面的转录组信息。
2. Small RNA
在建库技术方面,采用QIAseq NGS panels专有的数字NGS技术,基于QIAseq miRNA Library Kit的建库策略无需切胶分离小RNA(Gel-free),能够实现对外泌体miRNA等稀少样本的无偏向准确定量。结合最新的高通量测序技术和生物信息分析方案将为您提供最为全面的外泌体miRNA测序服务。
1、样本量
样本类型 |
Long RNA |
Small RNA |
血清、血浆 |
4ml |
4ml |
细胞培养上清、尿液等体液 |
50ml |
50ml |
外泌体 |
400μl |
400μl |
Total RNA |
500ng |
2ng,体积不小于20μl |
2、样本运输与保存
样本应-80℃低温保存,样品保存期间避免反复冻融;样本装于RNase-free离心管中,封口膜封好后,干冰运输。样品邮寄提前跟公司联系并告知快递单号。样本寄送必须随附送样单,送样单尽量填写完整、清晰,仔细核对确保填写信息与样本信息完全一致,并将填好的送样单发送到公司邮箱info@rengenbio.com。
相关产品信息
1、测序方案
内容 |
Long RNA |
Small RNA |
测序模式 |
PE150 |
SE50 |
测序数据量 |
6-10Gb clean data |
10Mb clean reads |
测序平台 |
Illumina Hiseq3000/4000 |
Illumina Hiseq3000/4000 |
2、数据分析
mRNA |
LncRNA |
CircRNA |
miRNA |
mRNA识别和注释 mRNA表达谱 差异mRNA筛选 差异mRNA聚类 差异mRNA GO分析 差异mRNA KEGG通路分析 |
LncRNA识别和注释 LncRNA表达谱 差异LncRNA筛选 差异LncRNA聚类 LncRNA靶基因分析 LncRNA靶基因GO分析 LncRNA靶基因KEGG通路分析
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circRNA识别与注释 circRNA标准化 circRNA表达谱 差异表达circRNA筛选 差异表达circRNA的靶基因分析 差异circRNA靶基因的GO分析 差异circRNA靶基因的KEGG分析 circRNA-miRNA相互作用预测 circRNA-miRNA网络 circRNA可视化 |
small RNA鉴定和注释 已知microRNA鉴定 新的microRNA预测 家族分析、结构分析 差异表达分析 差异表达miRNA靶基因分析 差异表达miRNA靶基因功能注释和富集分析 |
3、实验室收到样本后60个工作日完成检测及数据分析(单次送样量大于10个可能会出现延迟)。如果客户需要高级数据分析,费用根据分析内容另行收取。
产品数据